Uno de los problemas con los que me he encontrado al intentar utilizar Chronium en Linux y sincronizarlo con Xmarks, deriva a un bug de Xmarks,las versiones iniciales te crean una carpeta «Other booksmarks» que luego no puede sincronizar correctamente. Para solventar este problema debes:
1. Logearte en http://my.xmarks.com
2. Buscar la carpeta llamada «Other Bookmarks» en la raiz de tus bookmarks.
3. Mover todo el contenido que tenga dentro esa carpeta a fuera, a la raiz.
4. Eliminar esa carpeta usando my.xmarks.com
5. Abrir Chrome ir la pestaña de opciones avanzadas y realizar una descarga manual de los booksmarks.
A partir de ahí, la sincronización se debe realizar con normalidad.